Seis mil anos antes de Sora e Shiro chegarem a Disboard, a guerra consumiu a terra, rasgando os céus, destruindo estrelas e até ameaçando acabar com a raça humana. Em meio ao caos e à destruição, um jovem chamado Riku leva a humanidade para o amanhã em que seu coração acreditava. Um dia, nas ruínas de uma cidade de Elfos, ele conhece Shuvi, uma exilada que lhe pede para ensinar o que significa ter um coração humano.

Seiya e Os Cavaleiros do Zodíaco estão de volta para proteger a reencarnação da deusa Atena, mas uma obscura profecia paira sobre todos eles.