Uma história moderna de ação e aventura onde uma garota de 17 anos chamada Suzume ajuda um jovem misterioso a fechar as portas do outro lado que estão causando desastres por todo o Japão.

Um garoto do ensino médio que fugiu para Tóquio faz amizade com uma garota que parece capaz de manipular o clima.

Mitsuha é a filha do prefeito de uma pequena cidade, mas sonha em tentar a sorte em Tóquio. Taki trabalha em um restaurante em Tóquio e deseja largar o seu emprego. Os dois não se conhecem, mas estão conectados pelas imagens de seus sonhos.

Asuna é uma menina solitária. Ela tem o hábito de passar seus dias escutando uma música misteriosa em um rádio especial que ganhou de seu pai. Certo dia ela conhece um rapaz chamado Shun, e parte numa viagem de aventuras para entender as belezas e crueldades do mundo.