Um menino encontra um jardim mágico que lhe permite viajar no tempo e encontrar seus parentes de diferentes épocas, com a orientação da sua irmã mais nova do futuro.

Kenshin treina duro para aprimorar suas habilidades e deter Shishio, que pretende derrubar o governo e dominar o Japão.

O maléfico Makoto Shishio tenta derrubar o governo Meji. Kenshin Himura não tem outra escolha a não ser sacar a espada mais uma vez (apesar de ter prometido não