Johana, uma mulher sem passado, está se escondendo de Bowie, chefe de um programa espacial secreto. Em sua corrida ela encontra Martin e com a ajuda do colega de Bowie, Lance, os dois ajudam Martin a encontrar sua filha meio-alienígena.

O superagente Ethan Hunt e sua equipe aceitam mais uma missão mortal: provar sua inocência após serem incriminados de explodir o Kremlin.

Uma pirâmide até então desconhecida é encontrada na Antártica através de satélites, fazendo com que uma equipe de cientistas e aventureiros seja enviada para investigar o local. Porém lá eles fazem uma descoberta atra: a pirâmide serve de abrigo para duas raças alienígenas extremamente violentas, que estão em guerra.