Após a morte da mãe, Mahito se muda para a cidade natal dela. Lá, ele segue uma misteriosa garça rumo a um mundo fantástico, onde vivos e mortos se encontram.

A pequena Mary apanha uma flor encantada que a transporta para uma escola mágica. Mas uma pequena mentira vai revelar uma perigosa verdade.

O mestre da animação Hayao Miyazaki conta uma história inspirada na vida de Jirô Horikoshi, designer do avião Zero da Segunda Guerra.